Comparative study between biopsy and brushing sampling methods for detection of human papillomavirus in oral and oropharyngeal cavity lesions, / Estudo comparativo entre biópsia e escovado na pesquisa do papilomavírus humano em lesões de cavidade oral e de orofaringe

ABSTRACT INTRODUCTION: Many epidemiological studies have suggested that human papillomavirus (HPV), especially type 16, is involved in the genesis of squamous cell carcinoma of the oral cavity and oropharynx, especially in young, non-smoking patients; thus, its detection in lesions in this region is important. OBJECTIVE: To clarify the capacity of the brushing sampling method to detect the presence of HPV in oral or oropharyngeal lesions through polymerase chain reaction (PCR) testing, and to compare the results with those obtained by biopsy. METHODS: Prospective study of adult patients with oral or oropharyngeal lesions assessed by PCR, comparing biopsy specimens with samples obtained by the brushing method. The study was approved by the Research Ethics Committee of the institution. RESULTS: A total of 35 sample pairs were analyzed, but 45.7% of the brushing samples were inadequate (16/35) and, thus, only 19 pairs could be compared. There was agreement of results in 94.7% (18/19) of the pairs, with HPV identified in 16 of them. HPV DNA was detected in 8.6% (3/35) of biopsy and 5.7% (2/35) of brushing samples. CONCLUSION: There was no statistically significant difference between the two methods, but the brushing sampling method showed a higher number of inadequate samples, suggesting that it is an unreliable method for surveillance.

Resumo INTRODUÇÃO: Muitos estudos epidemiológicos indicam a participação do papilomavírus humano, especialmente o tipo 16, na carcinogênese dos tumores espinocelulares das cavidade oral e oro-faríngea, principalmente em jovens e não fumantes, sendo portanto importante sua detecção nas lesões desta região. OBJETIVO: Elucidar a habilidade do escovado em detectar o papilomavírus humano, pela reação em cadeia da polimerase, nas lesões orais e orofaríngeas, comparando os resultados com os obtidos por biópsia. MÉTODO: Estudo prospectivo de pacientes com lesões orais e orofaríngeas, pela reação em cadeia da polimerase, no qual foram pareados os resultados de amostras obtidas por escovado e por biópsia. A pesquisa foi aprovada pelo Comitê de Ética em Pesquisa da instituição. RESULTADO: Foram analisados 35 pares de amostras, porém estavam inapropriadas para análise 45,7% (16/35) das amostras obtidas por escovado, e portanto, somente 19 pares puderam ser comparados. Em 94,7% dos pares houve concordância dos resultados, sendo encontrado o papilomavírus humano − 16 em um destes pares. O ácido desoxirribonucleico do papilomavírus humano foi detectado em 8,6% (3/35) das biópsias e em 5,7% (2/35) dos escovados. CONCLUSÃO: Não houve diferença estatística entre os métodos, mas como houve um grande número de amostras obtidas por escovado inapropriadas, este parece não ser confiável para o rastreamento.

Quantification of HIV-1 viral RNA in the blood in needles used for venous puncture in HIV-infected individuals / Quantificação do HIV-1 RNA viral no sangue de agulhas usadas para punção venosa em indivíduos infectados pelo HIV

INTRODUCTION: Occupational HIV infection among healthcare workers is an important issue in exposures involving blood and body fluids. There are few data in the literature regarding the potential and the duration of infectivity of HIV type 1 (HIV-1) in contaminated material under adverse conditions. METHODS: We quantified HIV-1 viral RNA in 25×8mm calibre hollow-bore needles, after punctures, in 25 HIV-1-infected patients selected during the sample collection. All of the patients selected were between the ages of 18 and 55. Five samples were collected from 16 patients: one sample for the immediate quantification of HIV-1 RNA in the plasma and blood samples from the interior of 4 needles to be analyzed at 0h, 6h, 24h, and 72h after collection. In nine patients, another test was carried out in the blood from one additional needle, in which HIV-1 RNA was assessed 168h after blood collection. The method used to assess HIV-1 RNA was nucleic acid sequence-based amplification. RESULTS: Up to 7 days after collection, HIV-1 RNA was detected in all of the needles. The viral RNA remained stable up to 168h, and there were no statistically significant differences among the needle samples. CONCLUSIONS: Although the infectivity of the viral material in the needles is unknown, the data indicate the need to re-evaluate the practices in cases of occupational accidents in which the source is not identified.

INTRODUÇÃO: A infecção ocupacional pelo HIV entre os trabalhadores de saúde é uma importante questão em exposições envolvendo sangue e fluidos corporais. Os dados na literatura são escassos quanto ao potencial infectivo do HIV-1 em material contaminado e o intervalo de tempo em que a infectividade é mantida em condições adversas. MÉTODOS: Realizamos a quantificação de RNA viral do HIV-1 em agulhas ocas com calibre 25X8mm, após punções, em 25 pacientes infectados pelo HIV-1 selecionados durante coleta de sangue para exames. Todos os pacientes selecionados tinham idade variando entre 18 e 55 anos. De 16 pacientes foram coletadas 5 amostras: 1 amostra de sangue para quantificação imediata do RNA viral do HIV-1 no plasma e 4 agulhas para a análise ás 0h, 6h, 24h e 72h após a coleta. Em nove pacientes, um outro teste foi realizado no sangue de uma agulha adicional, na qual foi avaliada a presença de RNA viral do HIV-1 após 168h após a coleta do sangue. O método usado para avaliar o RNA do HIV-1 foi a amplificação baseada na sequência de ácidos nucléicos. RESULTADOS: O RNA do HIV-1 foi detectado em todas as agulhas até o sétimo dia após a coleta. O RNA viral manteve-se estável até 168h após a punção, sem diferença estatisticamente significante entre as agulhas coletadas. CONCLUSÕES: Embora a infectividade do material viral nas agulhas seja desconhecido, os dados apontam necessidade de reavaliação das condutas em casos de acidente com fonte desconhecida.

Aplicabilidade da metodologia de reação de polimerase em cadeia em tempo real na determinação do percentual de organismos geneticamente modificados em alimentos / Applicability of the real-time polymerase chain reaction based-methods in quantification of genetically modified organisms in foods

A detecção de organismos geneticamente modificados na cadeia alimentar é um aspecto importante para todos os assuntos envolvidos no controle de matéria-prima, na indústria de alimentos e na distribuição. A rotulagem e a rastreabilidade de organismos geneticamente modificados são questões atuais que são consideradas para o comércio e a regulamentação. Atualmente, a rotulagem de alimentos processados contendo material transgênico detectável é exigida pela legislação brasileira. O governo brasileiro publicou Decreto nº 4.680 em abril de 2003, que exige rotulagem para todos os alimentos ou ingredientes de alimento, com o limite para rotulagem de 1 por cento. Embora a tecnologia de reação em cadeia da polimerase tenha algumas limitações, a alta sensibilidade e especificidade explicam sua escolha por parte dos laboratórios interessados em realizar análises de detecção de organismos geneticamente modificados e seus derivados. Entre os métodos atualmente disponíveis, aqueles baseados na reação em cadeia da polimerase geralmente são aceitos, considerando a sensibilidade e a confiabilidade na detecção de material geneticamente modificado-derivado em análises de rotina. Neste artigo, apresenta-se uma revisão de métodos atualmente disponíveis baseados na reação em cadeia da polimerase para detecção, identificação e quantificação de organismos geneticamente modificados e seus derivados, discutindo sua aplicabilidade e suas limitações.

Detection of genetically modified organisms in the food chain is an important issue for all subjects involved in raw material control, food industry and distribution. Both labeling and traceability of genetically modified organisms are current issues that are considered for trade and regulation. Currently, labeling of genetically modified foods containing detectable transgenic material is required by the Brazilian legislation. The Brazilian government published the Decree nº 4.680 in April 2003, which requires labeling for all foods or food ingredients, with a stricter labeling threshold of 1 percent. Although polymerase chain reaction technology has some limitations, the high sensitivity and specificity explain why it has been the first choice of most analytical laboratories interested in detection of genetically modified organisms and their derived products. Among the currently available methods, polymerase chain reaction-based methods are accepted, considering the sensitivity and reliability for detection of genetically modified-derived material in routine analysis. In this paper, a review of currently available polymerase chain reaction methods for screening and quantifying genetically modified-derived ingredients is presented, discussing their applicability and limitations.